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三天后，柯南在寂静的样品间的垃圾通道内，隐隐约约听到有垃圾车的声音，他快速挣脱身上的绳索，并带着这些绳索从垃圾通道滑下去，他甚至将那些白布都原封不断的盖了回去。
在柯南离开之后，整个样品室安静异常，安室透算好时间走进来，如果不是安室透亲自将对方送过来，就连他都以为柯南本根没有来过这个地方。
安室透在打开垃圾通道查看，发现旁边有擦拭过的痕迹，他很快确定柯南已经逃离这里，这样他也就可以安心的潜入格蕾丝的实验室中，将那重要的U盘文件内容拷贝下来。
安室透转身离开，却在关上门的时候，拿出手机，给琴酒发去消息。
【编号实验体逃脱——波本】
琴酒那边没有迅速回过来消息，安室透也并不着急，他已经第一时间给琴酒发送相关情报，是琴酒选择的关押地点，对方逃脱的罪责怎么也不可能落在他的头上。
安室透在汇报完之后，就来到格蕾丝的实验室中，这次他并没有用着自己的身份卡，而是用的贝尔摩德的复制卡，刷卡记录上只会记录贝尔摩德的名字，安室透就这样大摇大摆的进入，并开始在电脑上拷贝那些对他有用的东西。
安室透果然是成年人，在看到那些柯南看着脸红心跳的图片时，他面不改色的开始操作，输入boss邮箱之后，打开隐藏文件夹，开始拷贝里面的内容，在拷贝即将完成的时候吧，他放在口袋中的手机一阵震动。
安室透内心咯噔一下，难道被发现了吗？
他看着即将结束的进度条，还是选择掏出手机查看一下，就差一点他并不想前功尽弃。
在他因为手机上会是朗姆的质问以及琴酒即将赶来的消息时，他看到屏幕上琴酒的回复：【两天后在某国神社刺杀一名议员，你负责伪装成保镖的身份靠近议员，将他引到狙击位点——琴酒】
安室透看着手机上的消息，他陷入狂喜，他准备假死脱离组织，只是奈何并没有合心意的任务，现在琴酒提供一个现成的任务给他，他一定要利用好这次的任务，将组织的情报传递出去。
至于那名议员，他会用替身将对方保下来，至于其他人……光明的胜利总要伴随牺牲，不是吗？
——
琴酒的安全屋中，白酒看着琴酒拟定好的任务，他眼中闪过一抹兴奋。
“琴酒同志，你为什么要把任务地点安排在这里。”白酒指着某国神厕问道。
“他们喜欢看这些。”琴酒淡声回复，语气中听不出到多少情感。
“他们？琴酒同志！你不愧是种花家的好朋友！你真的是个好人啊！”
白酒开始疯狂给琴酒发好人卡，他以为琴酒是在为种花家的人报仇，琴酒并没有承认什么，毕竟这是他答应过的，希望三次元的小粉丝们能够看得开心。
——
就在白酒给琴酒发好人卡的时候，柯南顶着浑身腐败的垃圾味道，跌跌撞撞的走到毛利侦探事务所的门前，他抬起手打开门，就和面庞上还带着泪痕的毛利兰的视线撞在一起。
在看到柯南的一瞬间，毛利兰的眼泪又掉了出来，她好不嫌弃柯南身上哪个腐烂的垃圾味道，走上前一把抱住柯南，小声啜泣着：“太好了柯南，你没事，你没事……”
她似乎收到很大打击，她抱着柯南的手越来越紧，柯南也用力回抱住毛利兰，太好了，小兰也没有事情，只是，接下来，柯南便听到了噩耗。
“柯南，优作叔叔和有希子阿姨去世了，我联系不上新一，你能联系上他吗？”
柯南：什么？
——水字数大番外——
你是一名精通机械造物的种花家医学生，在你终于研制出治疗肿瘤的纳米机器人之后，你被窃取你实验成果的其他国家间谍组织陷害，死在自己的实验室中，死时手中还紧紧握着琴酒的吧唧。
是的，你不仅是一名医学博士，你还是一只疯狂琴推，那种恨不得为琴酒去死，又或者变成琴酒的狗摇尾乞怜的琴推。
不知道是不是你的诚意感动上苍，又或者是你研究出抑制肿瘤生长发育成果来攒下的功德，你死亡之后，穿越了，并成功来到柯学世界。
和你原世界相同的是，你同样是一名精通机械造物的医学博士，而不同的是，你因为太过厉害被霓虹的众多研究学家们排挤，他们这个国度就是这样，聪明的人都会被标榜怪胎，说他们特立独行。
你并不在意，因为你本身是种花家的人，对霓虹并没有什么归属感，你在实验经费被停止之后，你想联系种花家那边，拿到绿卡然后回国，只是你发现，因为某个老贼不想失去种花家的市场，柯学世界中并没有提到种花家的各种事情，在这里也形同虚设。
你很难过，因为你发现你没有家了，你没有去处，就在你一筹莫展的时候，组织找上了你。
首先是朗姆派库拉索过来询问你的想法，你并不喜欢这个被几个小孩温柔对待就被策反的女人，你觉得她的洗白很草率，并且开始心疼费劲去救她还损失一辆鱼鹰的琴酒。
组织似乎很需要你的能力，在库拉索和你交际失败之后，朗姆决定启用色诱政策，他让贝尔摩德过来色诱你，因为不管男女，都拒绝不了性感的大姐姐，只是，你看着眼前这个让琴酒吃瘪过好几次的二五仔，心中更加恼火。
贝尔摩德在你面前还没有来得及摆什么诱惑的姿势，就被你直接关在门外，并差点被撞掉鼻子。
朗姆最后并没有办法，他选择出动琴酒，文的不行就来武的，绑也要给你绑回来。
很快，那就跟着琴酒回到组织基地中，并获得一间单独的实验室，组织中都传说你被琴酒狠狠的收拾了一顿才变得非常听话，因为你来到组织基地的时候，身上还带着些伤痕。
只有你知道，你身上的那些伤是因为看到琴酒太过于兴奋，你冲上前就要抱对方大腿，结果琴酒直接一个闪身，你便从楼梯上摔了下去，因为琴酒亲自接你的原因，你没有任何迟疑的就答应加入组织。
于是，你成为一名光荣的实验组成员，但是你没有代号，因为是新来的，在你没有做出业绩之前，你并不被重视。
你不知道组织需要什么，你随便窜了一个会自己行动的机械狗，他的表面和真正的小狗很像，只是仔细看能看出跑动时那关节的僵硬感。
你为了贴合组织的作风，将本来应该是陪伴机器人的机械狗改成能携带遥控炸弹，定点定时爆炸的炸弹狗，一时间米花町又多了不少迷之爆炸案。
你的发明东西的能力十分出色，甚至比柯南的神奇老爷爷都有过这而无不及，因为上一世的经验，你很快就汆出来一个可以接受定向调控的纳米机器人，你决定用这个机器人做些什么，让琴酒在组织中的生活更加安心。
组织中有很多情报，你没有事情的时候就会一一查看，这天你在上面看到了霓虹天皇和霓虹首相的家庭住址。
你搓着下巴，陷入沉思，看起来可以在他们两人的身上做做文章，如果霓虹天皇和霓虹首相被刺伤，整个霓虹一定会方寸大乱，他们会拼命搜寻刺杀的人，这种巨大的曝光程度是组织不能接受的。
你随手制作出一个小型蜘蛛机器人，并在蜘蛛机器人的身上撞上你最新研究出来的纳米机器人，你趁霓虹天皇和霓虹首相在红灯街一起聚会的时候，你掏出遥控器，利用蜘蛛机器人的口器，一人注射了一枚纳米机器人。
只要这个纳米机器人在的一天，这两个人的生命就会掌握在你的手上。
你很满意的回到组织基地，更让你开心的是，你在回到基地的时候，就看到了你心心念念的琴酒，只是对方似乎有工作，你跟了过去琴酒也默许，因为你很有用，只是你没有想到，琴酒的工作居然是安排四个新人的代号考核任务。
你看着那四张熟悉的面容，你一阵头大，今天是什么好日子，卧底都聚堆了。
你很快反应过来，你不能让他们进入酒厂，因为这将是琴酒噩梦的开始，就这样你开始威胁琴酒。
“琴酒，他们都是卧底，你赶紧把他们都杀了！”
琴酒觉得你有病，但是他并没有处置随意说话的你，而是去观察那四个人是什么反应，他们反应还算正常，并没有被突然拆穿的紧张感，但是你还是不依不饶，你决定打开电视，让琴酒看一下最新的新闻报道。
报道上正是霓虹首相和霓虹天皇去红灯区聚会被抓正着的采访，没错，这是你干的，你向媒体们透露了这个大新闻。
他们像是问到血腥味的鲨鱼，全部挤过去，你却告诉琴酒，你可以让他们立刻痛苦倒下，琴酒说想看看，你很快给他展示什么叫生不如死，什么叫爽到飞升。
琴酒看着霓虹首相和霓虹天皇两人痛苦扭曲的表情，他相信了你能够操控他们生命的话，于是，你利用这两个人的命威胁他，让他将那四个卧底都杀了，琴酒妥协，琴酒照做。
你：琴酒，你要是不杀他们，我就把霓虹天皇和霓虹首相都杀了哦~
琴酒最终还是对他们下手了，那四名卧底死不瞑目。
时间线很快飞速而过，就在你利用霓虹首相和天皇的命威胁他去热带乐园玩的时候，你们遇到了工藤新一，是的，不知道为什么，他跟上了你们，并听到你用霓虹首相爱那个和天皇性命威胁琴酒踢你屁股的话语。
你：这个高中生，不能留了！
于是，工藤新一也被琴酒杀死，他身体内亲自被琴酒注射一枚纳米炸弹，紧接着对方就被你操控杀死。
回到组织基地之后，你和琴酒又度过了一段你以为很幸福的时光，但是有人并不想让你过得痛快，没错，这个人就是雪莉，她因为姐姐的死亡开始作妖，即使没有赤井秀一的蛊惑，宫野明美还是选择带雪莉离开，但是她失败了。
雪莉决定停止试验抗议，你趴到琴酒耳边悄悄建议。
你：雪莉可不像个好人呐！快杀了他，不然我可就杀霓虹天皇和霓虹首相了~
琴酒亲手杀了雪莉，你很开心，因为对琴酒的威胁已经没有，你不仅感叹，科技果然改变命运。